Química

Movimiento de dominio en proteínas: movimientos de cizallamiento y bisagra

Movimiento de dominio en proteínas: movimientos de cizallamiento y bisagra


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Ejemplo de hexoquinasa: un movimiento de cizallamiento

Clasificación: [D-s-2]

La hexoquinasa (EC 2.7.1.1) de la levadura de panadería Saccharomyces cerevisiae también pertenece al grupo de proteínas que inician el movimiento de cizallamiento tan pronto como el sustrato se une. Este movimiento de cizallamiento se caracteriza como XBAabx, es decir, tres áreas móviles de la proteína (indicadas en letras minúsculas) se mueven en relación con tres áreas inmóviles (en letras mayúsculas). En el centro hay una superficie formada por hélices a, que se mueve a través de la superficie A. A ambos lados de esta capa central se encuentran las estructuras de láminas β by B, que a su vez se encuentran junto a las superficies x y X.

Los dos dominios

La hexoquinasa se compone de dos dominios. El primer dominio de esta enzima, llamado lóbulo grande, se extiende desde los residuos 1 a 78 y desde los residuos 210 a 486 (amarillo, magenta) y el segundo dominio que forma el lóbulo pequeño incluye los residuos 79 a 209 (azul).

Durante la catálisis, la brecha entre los dos dominios se cierra. Cuando Bennett & Steitz describieron este movimiento de dominio por primera vez en 1980, se le asignó el "movimiento de flexión de bisagra". Investigaciones posteriores mostraron, sin embargo, que se trata más de un movimiento de cizallamiento ("movimiento de cizallamiento de la interfaz de hélice"), en el que las hélices se desplazan de 0,2 a 1 Å y se producen rotaciones de 4 ° a 10 °. Además, cuando el sustrato está unido, la hoja β se retuerce en el dominio pequeño (una esquina de esta hoja forma un puente en H con la glucosa del sustrato).

Nota
http://molmovdb.mbb.yale.edu/MolMovDB: Aquí se muestra el movimiento de la hexoquinasa en la película.


Video: Proteínas integrales (Julio 2022).


Comentarios:

  1. Khentimentiu

    Es una buena idea.

  2. Vit

    ¡Es verdad! Creo que es una buena idea.

  3. Bitten

    Efectivamente, y como no lo habia adivinado antes

  4. Ealdwode

    Recientemente se convirtió en su lector e inmediatamente en suscriptor. Gracias por la publicacion.

  5. Albion

    Cometes un error. Lo sugiero que debatir.

  6. Tlanextic

    ¡Por supuesto! ¡No cuentes las historias!



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